Emzik ilk alındığı zaman ılık sabunlu su ile yıkanmalıdır. Daha sonra tabii ki ev içinde yere düştüğünde sadece sıcak sudan geçirmek yoluyla temizlenebilir ama eğer sokakta yere düşmüş ise sıcak ve sabunlu su ile yıkanmalıdır. Emziği tam olarak dezenfekte etmek için beş dakika kaynatmak yeterli olucaktır. Bunun dışında emziği bebeğe vermeden önce bir kontrol etmek, çatlakları var mı, patlak veya yırtık yerleri var mı, çocuğun ağzına kaçıp boğazına takılabilecek parçaları var mı diye denetlenmesi çok önemlidir. Eğer hiçbir belirti yoksa ve düzgün bir yüzeye sahipse emzik sadece su ve sabunla yıkanarak bebeğe verilebilir. Bunun dışında hergün bulaşık makinesine konularakda günlük temizlik sağlanabilinir. Emziğin kullanım süresi çocuğun emme sıklığı ve süresiyle alakalıdır. Genellikle iki – üç ayda bir emzik parçalanır veya eskir ama çocuk devamlı emzik emiyorsa bu süre kısalabilir veya çok seyrek emiyorsa sadece gece uyurken emzik emiyorsa bu süre uzayabilir. Emziğin yapış yapış olması ya da aralarında çatlaklar görünmesi temizlenmesini güçleştireceğinden ve mikrop barındıracağından dolayı o hale gelmiş bir emziğin hiç bekletilmeden atılması ve yenisinin alınması önerilmektedir.